プレイヤーは謎の生命体「ラプチャー」に占拠された地上を奪還するために戦う少女型のヒューマノイド「NIKKE」(ニケ)達を指揮する「指揮官」となります。遮蔽物から身を乗り出して敵に照準を定め攻撃を行う「射撃」や遮蔽物に身を隠してリロードしながら相手の攻撃をやり過ごす「ハイド」を駆使して敵を撃破する事になります。キャラは同時に5人まで編成でき、敵の状況に応じて切り替えることができますのでキャラの相性を考えた戦略性のあるバトルを楽しめます。
人類は目的も不明、交渉も不可という謎の生命体「ラプチャー」の圧倒的な侵攻の前に敗北します。ラプチャーは人類の天敵と言わんばかりに一瞬にして地上を火の海に変えてしまいました。最終手段として開発中だった人型兵器でさえ戦況を逆転させることはできず、人類は完璧な敗北を喫した上に地上をラプチャーに奪われ、地下の奥深くへと住処を移す事になりました。それから数十年が過ぎ、人類の新たな住処である「アーク」で「対ラプチャー用決戦人型兵器」である少女たちが目を覚まします。人類は少女たちが自分たちの矢となってくれることを、復讐の刀となってくれることを祈りました。そうした痛切な願いが込められた名前とともに少女たちは地上へと向かいます。人類に勝利をもたらす最後の希望。その名は『ニケ』。